Персоналният суперкомпютър с GPU ускорение на изчисленията ще се използва за анализ на електростатичните заряди в протеините в Института по органична химия с Център по фитохимия при Българската академия на науките
Първият в България персонален суперкомпютър за високопроизводителни GPU изчисления, на базата на NVIDIA® Tesla™ C1060 вече е факт. Системата е създадена с цел да обслужва нуждите на Института по органична химия с Център по фитохимия при Българската академия на науките.
Използването на персоналния компютър в Института по органична химия ще бъде основно за анализ на електростатичните заряди в протеините, възползвайки се от напълно от високопроизводителната CUDA-базирана паралелизация, осигурявана от системата. Тези изчисления за пренос на заряда в протеините под електростатичен контрол ще бъдат използвани за разработката на бъдещи високотехнологични изчислителни системи. Професор Борис Атанасов от Института по органична химия с Център по фитохимия очаква с нетърпение възможността да използва високопроизводителната изчислителна мощ на първия в България персонален суперкомпютър на базата на NVIDIA Tesla.
“Основната цел на приложение на персоналния суперкомпютър е за анализ на електростатичните заряди в протеините и по-конкретно: високопроизводителна CUDA-базирана паралелизация при изчисление на уравнението на Пойзън-Болтцман; изчислителен анализ на динамиката при пренос на заряда (взаимно свързан протонен и електронен пренос); топологичен анализ на експериментална плътност на електрони в протеините - квантовата теория за атомите в молекулите на Бадер; високопроизводителна визуализация на тримерни електростатични полета на протеини с използването на експериментални подходи”, заяви Професор Борис Атанасов, разяснявайки за какво по-конкретно ще се използва огромната производителност на персоналния суперкомпютър на базата на NVIDIA Tesla C1060.
Работната станция, асемблирана от фирма Перси ЕООД, е на базата на шаси и дънна платка Supermicro и използва професионален графичен контролер NVIDIA Quadro FX 3800 за визуализация и два изчислителни процесора NVIDIA Tesla C1060 за постигане на оптимално визуално качество и впечатляваща изчислителна мощ. Именно благодарение на NVIDIA Tesla C1060 работната станция се превръща във високопроизводителен персонален суперкомпютър, който дава възможност на професионалистите да постигнат значително по-висока производителност, комбинирана с отлична енергийна ефективност спрямо използването само на процесорно-ориентирани решения. Изчислителните процесори Tesla C1060 използват многоядрената паралелна архитектура на NVIDIA, която в комбинация с C-базираната CUDA среда за разработка, отключва пълния потенциал на графичните процесори за извършване на много тежки изчисления.